Stonkové rostliny mají stonek zakořeněný v substrátu, který roste za světlem k hladině. Tyto rostliny je proto nutné pravidelně zaštipovat. V opačném případě dorůstají k hladině a stíní ostatní. Listy na spodních částech stonků navíc trpí nedostatkem světla, žloutnou a opadávají. Rostliny zaštipujeme asi 5 cm nad substrátem, když dosáhnou výšky asi 1/2 až 2/3 výšky vodního sloupce podle jejich umístění a vzrůstu. Odštíplé konce lodyh opětovně sázíme do substrátu nejlépe pinzetou.
TIP! Před sázením si lodyhy zakrátíme do dvou až tří rozměrů. Při sázení postupujeme tak, že nejkratší rostliny sázíme do popředí trsu a až za nimi ty větší. Vznikne tak dojem prostorové perspektivy a akvárium dostane lepší vzhled. Většina těchto rostlin má slabší kořenový systém a přijímají živiny celým povrchem listů a stonků. Sázíme je skoro vždy ve skupinách. Jsou to např. rostliny rodu Myriphyllum, Cabomba, Limnopila, Hygrophila, Ludwigia, Rotala aj.